Introduction to partitioning and mixed models for biodiversity analysis in R
Section outline
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The theoretical bases and practical features of the approaches described in the following units are introduced. An outline of the whole course is also given.
Sono introdotte le basi teoriche e le funzionalità pratiche descritte nelle unità seguenti. Sarà anche data una panoramica su tutto il corso.
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A short overview of the R software capabilities and potential uses.
Una breve panoramica sulle possibilità e i potenziali usi del software R.
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Introduction to partitioning the biodiversity of all individuals in a given region into within and between local communities. Biodiversity partitioning is referred to a generalized entropy measure including most popular measures of biodiversity (Species richness, Shannon, Simpson) as special cases.
Introduzione alla partizione della biodiversità di tutti gli esemplari in una determinata regione all'interno o fra comunità locali. La partizione della biodiversità è riferita alla misura della entropia generalizzata includendo le più usate misure di biodiversità (richezza delle specie, Shannon, Simpson) come casi particolari.
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Unit IV - Data Management and Biodiversity partitioning using the R package entropartUnità IV - Gestione dati e partizione della biodiversità con il package entropart di R
The basics of data management and how to use the R package entropart that implements biodiversity partitioning and the generalized entropy framework.
Le basi della gestione dei dati e come usare il package di R entropart che implementa partizionamento della biodiversità e il framework dell'entropia generalizzata.
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Unit V - Mixed models for biodiversity analysisUnità V - Modelli misti per l'analisi della biodiversità
Mixed effects models are introduced to investigate the variation of biodiversity measures with fixed effects of ecological explanatory factors and random effects ruled by sources of variability corresponding to alternative definitions of the local communities or repeated measurements.
Modelli ad effetti misti sono utilizzati per studiare la variazione delle misure della biodiversità con effetti fissi dovuti a fattori esplicativi ecologici e effetti casuali dovuti a fonti di variabilità come definizioni alternative di comunità locali o misure ripetute.
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Unit VI - Mixed models for biodiversity analysis in RUnità VI - Modelli misti per l'analisi della biodiversità in R
Mixed effects models estimation and analysis using the R package nlme. Examples of biodiversity assessment are carried out using ecological datasets.
Stima ed analisi dei modelli ad effetti misti utilizzando il pacchetto di R nlme. Sarranno effettuati stime di biodiversità utilizando dataset ecologici.
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The methods and R packages introduced in the previous units are applied to analyse biodiversity partitioning in the Po River delta.
I metodi e i pacchetti di R visti nelle unità precedenti sono utilizzate per analizzare il partizionamento della biodiversità nel delta del fiume Po.